MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 44631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016513	ATTT	2	8	19	26	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016513	TAT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016513	AAT	2	6	57	62	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016513	AGG	2	6	65	70	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016513	ACA	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966242
6	NC_016513	TGA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966242
7	NC_016513	AAC	2	6	206	211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966242
8	NC_016513	GAT	2	6	223	228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966242
9	NC_016513	TCA	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966242
10	NC_016513	TCA	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966242
11	NC_016513	CAG	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016513	ATT	2	6	325	330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016513	CTT	2	6	333	338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016513	TC	3	6	341	346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016513	A	6	6	411	416	100 %	0 %	0 %	0 %	365966243
16	NC_016513	AGTT	2	8	427	434	25 %	50 %	25 %	0 %	365966243
17	NC_016513	ATT	2	6	495	500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966243
18	NC_016513	AAG	2	6	526	531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966243
19	NC_016513	A	7	7	556	562	100 %	0 %	0 %	0 %	365966243
20	NC_016513	TTTTAT	2	12	588	599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016513	ATCG	2	8	726	733	25 %	25 %	25 %	25 %	365966244
22	NC_016513	TGT	2	6	857	862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966244
23	NC_016513	CTT	2	6	867	872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966244
24	NC_016513	CTT	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966245
25	NC_016513	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	365966245
26	NC_016513	CTT	2	6	995	1000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966245
27	NC_016513	GGTA	2	8	1021	1028	25 %	25 %	50 %	0 %	365966245
28	NC_016513	TTAATC	2	12	1089	1100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016513	AAT	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016513	TTA	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016513	TA	3	6	1159	1164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016513	AAAT	2	8	1166	1173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016513	TA	3	6	1228	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016513	A	6	6	1253	1258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016513	TCA	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016513	TTG	2	6	1432	1437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016513	TAT	2	6	1482	1487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016513	GCGGTA	2	12	1517	1528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016513	GTT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966246
40	NC_016513	CG	3	6	1614	1619	0 %	0 %	50 %	50 %	365966246
41	NC_016513	GAATG	2	10	1621	1630	40 %	20 %	40 %	0 %	365966246
42	NC_016513	TGA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966246
43	NC_016513	T	6	6	1719	1724	0 %	100 %	0 %	0 %	365966246
44	NC_016513	ATT	2	6	1726	1731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966246
45	NC_016513	A	6	6	1751	1756	100 %	0 %	0 %	0 %	365966246
46	NC_016513	TA	3	6	1787	1792	50 %	50 %	0 %	0 %	365966246
47	NC_016513	TCA	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966246
48	NC_016513	CAAA	2	8	1907	1914	75 %	0 %	0 %	25 %	365966246
49	NC_016513	AAAC	2	8	1916	1923	75 %	0 %	0 %	25 %	365966246
50	NC_016513	TTA	2	6	1950	1955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966246
51	NC_016513	TTA	2	6	1976	1981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966246
52	NC_016513	AGTC	2	8	2048	2055	25 %	25 %	25 %	25 %	365966246
53	NC_016513	AAG	2	6	2058	2063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966246
54	NC_016513	AATCA	2	10	2078	2087	60 %	20 %	0 %	20 %	365966246
55	NC_016513	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	365966247
56	NC_016513	ACT	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966247
57	NC_016513	AAC	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966247
58	NC_016513	CAT	2	6	2237	2242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966247
59	NC_016513	AGC	2	6	2264	2269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966247
60	NC_016513	GAA	2	6	2270	2275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966247
61	NC_016513	A	6	6	2433	2438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016513	GAT	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966248
63	NC_016513	ATTA	2	8	2643	2650	50 %	50 %	0 %	0 %	365966248
64	NC_016513	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966248
65	NC_016513	ATC	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016513	AAT	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016513	TCA	2	6	2845	2850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016513	TAA	2	6	2887	2892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016513	TTCT	2	8	3013	3020	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016513	ACC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016513	TTG	2	6	3061	3066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016513	CGG	2	6	3074	3079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016513	TTC	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016513	TG	3	6	3089	3094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016513	CACAA	2	10	3205	3214	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016513	CCG	2	6	3233	3238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016513	T	7	7	3250	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016513	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016513	TGG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016513	ATT	2	6	3526	3531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016513	TGG	2	6	3551	3556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016513	GCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016513	ATT	2	6	3627	3632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016513	AT	3	6	3637	3642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016513	GTG	2	6	3652	3657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016513	GCT	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016513	AAC	2	6	3740	3745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016513	TAA	2	6	3772	3777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016513	T	6	6	3793	3798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016513	TTTG	2	8	3804	3811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016513	CAAA	2	8	3835	3842	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016513	T	6	6	3858	3863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016513	CTA	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016513	CAA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016513	A	6	6	3900	3905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016513	ACG	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966249
97	NC_016513	TTC	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966249
98	NC_016513	TGCACG	2	12	4081	4092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365966249
99	NC_016513	ATATT	2	10	4109	4118	40 %	60 %	0 %	0 %	365966249
100	NC_016513	TCG	2	6	4133	4138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966249
101	NC_016513	ACGC	2	8	4153	4160	25 %	0 %	25 %	50 %	365966249
102	NC_016513	TTG	2	6	4161	4166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966249
103	NC_016513	TGC	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966249
104	NC_016513	GTT	2	6	4266	4271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966249
105	NC_016513	CCA	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966249
106	NC_016513	ATT	2	6	4309	4314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966249
107	NC_016513	GAT	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966249
108	NC_016513	CGC	2	6	4354	4359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966249
109	NC_016513	TTTA	2	8	4424	4431	25 %	75 %	0 %	0 %	365966250
110	NC_016513	CAT	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
111	NC_016513	AAG	2	6	4597	4602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966250
112	NC_016513	T	6	6	4641	4646	0 %	100 %	0 %	0 %	365966250
113	NC_016513	ATT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966250
114	NC_016513	TAA	2	6	4677	4682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966250
115	NC_016513	CAC	2	6	4733	4738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966250
116	NC_016513	TAT	2	6	4832	4837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966250
117	NC_016513	AC	3	6	4901	4906	50 %	0 %	0 %	50 %	365966250
118	NC_016513	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966250
119	NC_016513	T	6	6	5064	5069	0 %	100 %	0 %	0 %	365966250
120	NC_016513	CAC	2	6	5219	5224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966250
121	NC_016513	TCA	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
122	NC_016513	ACC	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966250
123	NC_016513	CAA	2	6	5396	5401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966250
124	NC_016513	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966250
125	NC_016513	TCCAT	2	10	5562	5571	20 %	40 %	0 %	40 %	365966250
126	NC_016513	GGGC	2	8	5593	5600	0 %	0 %	75 %	25 %	365966250
127	NC_016513	TCA	2	6	5614	5619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
128	NC_016513	ATA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966250
129	NC_016513	ACT	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966250
130	NC_016513	T	6	6	5705	5710	0 %	100 %	0 %	0 %	365966250
131	NC_016513	TTC	2	6	5794	5799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966251
132	NC_016513	GTTC	2	8	5811	5818	0 %	50 %	25 %	25 %	365966251
133	NC_016513	GCC	2	6	5849	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966251
134	NC_016513	A	7	7	5944	5950	100 %	0 %	0 %	0 %	365966251
135	NC_016513	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365966251
136	NC_016513	ATA	2	6	5990	5995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966251
137	NC_016513	TTTA	2	8	6067	6074	25 %	75 %	0 %	0 %	365966251
138	NC_016513	TAC	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966251
139	NC_016513	GCC	3	9	6097	6105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966251
140	NC_016513	A	7	7	6121	6127	100 %	0 %	0 %	0 %	365966251
141	NC_016513	CGCTTT	2	12	6166	6177	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	365966251
142	NC_016513	CTGC	2	8	6375	6382	0 %	25 %	25 %	50 %	365966251
143	NC_016513	CTT	3	9	6396	6404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966251
144	NC_016513	GCA	2	6	6416	6421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966251
145	NC_016513	TCAGCT	2	12	6440	6451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365966251
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148	NC_016513	TTCT	2	8	6601	6608	0 %	75 %	0 %	25 %	365966251
149	NC_016513	GTT	2	6	6630	6635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966251
150	NC_016513	GTT	2	6	6654	6659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966251
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153	NC_016513	T	6	6	6733	6738	0 %	100 %	0 %	0 %	365966251
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159	NC_016513	CTT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365966252
160	NC_016513	CCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966252
161	NC_016513	ATTGT	2	10	7077	7086	20 %	60 %	20 %	0 %	365966252
162	NC_016513	GCC	2	6	7154	7159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966252
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195	NC_016513	ATTG	2	8	8885	8892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
196	NC_016513	GAAAAA	2	12	8898	8909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016513	AAAT	2	8	8930	8937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_016513	TTA	2	6	11920	11925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_016513	ATT	2	6	11957	11962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016513	CTA	2	6	11992	11997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_016513	A	6	6	12012	12017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016513	AAT	2	6	12063	12068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016513	T	6	6	12081	12086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_016513	CA	3	6	12201	12206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
264	NC_016513	TTC	2	6	12242	12247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_016513	TC	3	6	12266	12271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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270	NC_016513	ATTT	2	8	12392	12399	25 %	75 %	0 %	0 %	365966257
271	NC_016513	TAAA	2	8	12458	12465	75 %	25 %	0 %	0 %	365966257
272	NC_016513	ACA	2	6	12570	12575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365966257
273	NC_016513	CTT	2	6	12628	12633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_016513	A	6	6	12721	12726	100 %	0 %	0 %	0 %	365966258
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284	NC_016513	GCT	2	6	13027	13032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966258
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403	NC_016513	A	6	6	18289	18294	100 %	0 %	0 %	0 %	365966265
404	NC_016513	CAG	2	6	18300	18305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_016513	TA	3	6	18334	18339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_016513	GTA	2	6	18344	18349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
407	NC_016513	CGC	2	6	18474	18479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365966266
408	NC_016513	TAA	2	6	18531	18536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966266
409	NC_016513	GGT	2	6	18577	18582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365966266
410	NC_016513	TAA	2	6	18603	18608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966266
411	NC_016513	GTT	3	9	18626	18634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966266
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414	NC_016513	TGA	2	6	18722	18727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365966266
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419	NC_016513	GC	3	6	18998	19003	0 %	0 %	50 %	50 %	365966266
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421	NC_016513	TCA	2	6	19150	19155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966266
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432	NC_016513	TGC	2	6	19747	19752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966266
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435	NC_016513	TTGAAT	2	12	19941	19952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365966266
436	NC_016513	GCG	2	6	19978	19983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	365966266
437	NC_016513	AC	3	6	20013	20018	50 %	0 %	0 %	50 %	365966266
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439	NC_016513	AAT	2	6	20141	20146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966266
440	NC_016513	CAT	2	6	20154	20159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966266
441	NC_016513	GTA	2	6	20187	20192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_016513	A	6	6	20197	20202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_016513	TTA	2	6	20243	20248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_016513	CTT	2	6	20279	20284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_016513	ATAAA	2	10	20308	20317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_016513	TTA	2	6	20374	20379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966267
447	NC_016513	TAT	2	6	20401	20406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966267
448	NC_016513	A	7	7	20443	20449	100 %	0 %	0 %	0 %	365966267
449	NC_016513	A	7	7	20456	20462	100 %	0 %	0 %	0 %	365966267
450	NC_016513	GAAA	2	8	20479	20486	75 %	0 %	25 %	0 %	365966267
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457	NC_016513	AACT	2	8	20785	20792	50 %	25 %	0 %	25 %	365966267
458	NC_016513	ATC	2	6	20820	20825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966267
459	NC_016513	TAT	2	6	20837	20842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966267
460	NC_016513	AAG	2	6	20845	20850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365966267
461	NC_016513	ATA	2	6	20884	20889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966267
462	NC_016513	T	6	6	20950	20955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_016513	CAT	2	6	21085	21090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966268
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498	NC_016513	A	6	6	22623	22628	100 %	0 %	0 %	0 %	365966269
499	NC_016513	AAAC	2	8	22662	22669	75 %	0 %	0 %	25 %	365966269
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